Karakterisasi Molekular Podovirus RsoP1IDN yang menginfeksi Ralstonia solanacearum asal Indonesia

Hardian Susilo Addy, S.P., M.P., Ph.D || Thursday, 28 May 2020

Bakteriofag merupakan virus yang menginfeksi bakteri dengan spesies inang yang cukup spesifik. Sebuah bakteriofag penyebab lisis pada bakteri Ralstonia solanacearum telah diisolasi dari tanah di Indonesia. Bakteriofag tersebut diberi nama Ralstonia phage RsoP1IDN. Secara morfologi dan molekular, bakteriofag ini memiliki genom yang berupa double-stranded DNA yang linier dengan ukuran keseluruhan sebesar 41,135 bp yang pada kedua ujungnya terdapat terminal repeats sepanjang 413-bp. Genom RsoP1IDN memiliki 41 open reading frames (ORF) yang memiliki kedekatan dengan Ralstonia phage RSB1 (Jepang). Meskipun mirip, namun RsoP1IDN memiliki gen putatif yang menyandikan HNH homing endonuclease serta memiliki kisaran inang yang sempit dibandingkan RSB1. Secara filogenetik dan analisa genom diketahui bahwa baik bakteriorag RsoP1IDN atau RSB1 sama-sama dikelompokkan dalam genus yang baru yaitu Genus Pradovirus dan bukan genus Phikmvvirus sebagaimana yang dikelompokkan sebelumnya. Bakteriofag RsoP1IDN ini menarik karena merupakan bakteriofag pertama yang diisolasi dari Indonesia dan telah dilakukan analisa lengkap berdasarkan sekuens keseluruhan genom dan diusulkan sebagai spesies Ralstonia virus RsoP1IDN.

Informasi lebih detil artikel ini dapat dibaca pada Archives of Virology


Keywords: Bacterial wilt; Phage therapy; Podoviridae; Pradovirus; Ralstonia solanacearum